Am Paul-Natorp-Gymnasium gelten die unten aufgeführten Unterrichtszeiten. Die Doppelstunden werden in der Regel im Block unterrichtet. Zu der dort jeweils integrierten 5-minütigen Pause wird nicht geklingelt, so dass die Lerngruppen über den Zeitpunkt individuell entscheiden können. Randstunden können ggf. durch Absprachen andere Anfangszeiten haben (z. B. Bezirks- und Sportkurse). Ein Wechsel auf Kurzstunden (z.B. bei signifikanter Hitze im Schulgebäude) wird stets vorher über den Vertretungsplan angekündigt.